Engagierte Menschen der Kinderklinik und des sozialpädiatrischen Zentrums Memmingen erkannten den Bedarf eines stationären Kinderhospizes in Bayern, um Familien mit einem unheilbar und lebensverkürzend erkrankten Kind stationär sowie auch ambulant zu helfen und zu begleiten. Auf Basis dieses Anliegens gründeten sie am 8. Oktober 2001 den Förderverein Kinderhospiz im Allgäu e.V. mit dem Ziel, das erste Kinderhospiz in Bayern sowie im gesamten süddeutschen Raum zu errichten.

Am 6. August 2003 wurde eine gemeinnützige GmbH mit dem Namen Kinderhospiz St. Nikolaus - süddeutsches Kinderhospiz gGmbH gegründet.

Nach 4 Jahren Planungs- und Bauzeit konnte am 30. November 2006 das Kinderhospiz St. Nikolaus in einem mehrtägigen Event feierlich seiner Bestimmung übergeben und damit eine große Versorgungslücke im süddeutschen Raum geschlossen werden. Am 1. März 2007 kamen die ersten Familien in das neue „Haus voller Leben“.

Zur finanziellen und nachhaltigen Sicherung wurde am 5. Dezember 2007 durch den Stifter Kinderhospiz im Allgäu e.V. die Süddeutsche Kinderhospiz-Stiftung, als eine rechtsfähige öffentliche Stiftung des bürgerlichen Rechts gegründet. Sie ist die alleinige Trägerin des Kinderhospizes St. Nikolaus. Die Verwirklichung des Stiftungszwecks beinhaltet insbesondere die konsequente langfristige und dauerhafte Sicherung des Kinderhospizes St. Nikolaus und der gesamten Kinderhospizarbeit im süddeutschen Raum.

Um im Allgäu betroffene Familien im häuslichen Bereich zu unterstützen, rief der Kinderhospiz im Allgäu e.V. im Januar 2004 den Ambulanten Kinder- und Jugendhospizdienst Allgäu ins Leben. Die ehrenamtlichen Hospizbegleiter*Innen werden in der im Jahr 2007 eigens gegründeten Süddeutschen Kinderhospiz Akademie ausgebildet. Der e.V. und die Stiftung haben es sich zur Aufgabe gemacht, die Aus-, Fort- und Weiterbildung der in der Kinderhospizarbeit Tätigen zu intensivieren und zu professionalisieren. Die Akademie verankert durch ihr Angebot von Palliative Care Kursen, Seminaren, Workshops und Fortbildungen die Kinderhospizarbeit in der breiten Öffentlichkeit.

Am 19.6.2022 wurde nach einer 2-jährigen Planungs- und Bauzeit das „Süddeutsche Kinderhospiz-Zentrum“ gegenüber dem Kinderhospiz St. Nikolaus eröffnet. Satzungskonform zentralisiert es die Kinderhospizarbeit im gesamten süddeutschen Raum. Die Strukturen aller Kinderhospiz-Institutionen wurden in diesem „Haus der Begegnung“ idealerweise zusammengelegt und optimiert.